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基于AI功能寡肽药物开发取得进展



2022年3月1日,同济大学孙瑶教授、王佐林教授教授团队与北京航空航天大学王晓刚教授、张永彪教授团队合作在Bone Research 在线发表题为“Generation of functional oligopeptides that promote osteogenesis based on unsupervised deep learning of protein IDRs”的研究论文,该研究利用无监督深度学习模型来学习大约 171 种已知成骨蛋白的无序区域的语义模式。随后,基于蒙特卡罗模拟从这种语义模式生成寡肽,然后从程序输出的候选寡肽中选取推荐值较高的序列进行体内体外功能评价。



一种五氨基酸寡肽 (AIB5P) 具有很强的骨形成促进作用,这在多个小鼠模型中确定(例如,骨质疏松症、骨折和植入物的骨整合)。从机制上讲,该研究发现 AIB5P 通过与整合素 α5 亚基结合从而激活 FAK 信号传导来促进成骨。总之,该研究成功地建立了基于 DL 模型的寡肽发现策略,并展示了其从细胞学筛选到动物实验验证的实用性。









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